Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KeraO35367 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KeraO35367 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KeraO35367 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms