Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Casq1O09165 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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