Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sema3aO08665 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms