Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm3239L7N2D9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm3239L7N2D9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm3239L7N2D9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm3239L7N2D9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm3239L7N2D9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm3239L7N2D9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm3239L7N2D9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm3239L7N2D9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm3239L7N2D9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm3239L7N2D9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3239L7N2D9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm3239L7N2D9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3239L7N2D9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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