Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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