Protein–RNA interactions for Protein: K7N693

Gm3043, Predicted gene 10408, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3043K7N693 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3043K7N693 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms