Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20877J3QPZ4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20877J3QPZ4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms