Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms