Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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