Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
E030018B13RikJ3QMS9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms