Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms