Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8247F6VRJ8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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