Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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