Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms