Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pate1E9Q658 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pate1E9Q658 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pate1E9Q658 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms