Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20425E9Q035 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms