Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc8E9PWG2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms