Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms