Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms