Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc6D3YZP9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms