Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf217D3YYI7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnf217D3YYI7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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