Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp26c1B2RXA7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms