Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms