Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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PtprbB2RU80 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms