Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zscan5bB2RTN3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms