Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms