Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NhsB1AV60 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NhsB1AV60 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms