Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rtf1A2AQ19 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms