Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabreA2AMW3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms