Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam43bA2AM80 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam43bA2AM80 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms