Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Frmpd1A2AKB4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Frmpd1A2AKB4 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms