Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup62clA2AG10 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nup62clA2AG10 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms