Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm16211-201ENSMUST00000147722 1620 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms