Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Speer3W4VSP1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Speer3W4VSP1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Speer3W4VSP1 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Speer3W4VSP1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Speer3W4VSP1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Speer3W4VSP1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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