Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3550W4VSN7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms