Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cldn7Q9Z261 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn7Q9Z261 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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