Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms