Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccl8Q9Z121 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms