Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms