Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bgrQ9WUZ7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms