Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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