Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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