Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp21Q9QZL6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms