Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk3Q9QZL0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms