Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn8Q9QZ49 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms