Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms