Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mkrn1Q9QXP6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mkrn1Q9QXP6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms