Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Limd1Q9QXD8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Limd1Q9QXD8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Limd1Q9QXD8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Limd1Q9QXD8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Limd1Q9QXD8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Limd1Q9QXD8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Limd1Q9QXD8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Limd1Q9QXD8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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