Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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