Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chaf1aQ9QWF0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chaf1aQ9QWF0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms